肺癌GeCIP域

描述

肺癌是由肺组织中不受控制的细胞生长引起的。主要有两种类型——小细胞肺癌和非小细胞肺癌。在世界范围内,它是男性癌症相关死亡的最常见原因,是女性的第二大常见原因。绝大多数病例(85%)是由长期吸烟引起的。其余的病例是由于空气污染,如石棉、二手烟或罕见的遗传性肺癌。

肺癌GeCIP域将研究患者正常的非癌症组织(生殖系)和肿瘤(体细胞)的DNA。他们的目的是更好地了解当癌症扩散时,DNA发生了什么变化。他们的目标是找出这些DNA变化是否能帮助我们更好地描绘肿瘤的特征,并决定使用更有效的治疗方法。

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子域名 子域名铅/秒 188金宝慱应用程序研究描述
肿瘤进化与适应子领域 斯旺顿,勒奎恩,米德尔顿,简斯,坎贝尔,芬内尔,凡卢,卢斯库姆 a.确定肺癌(NSCLC/SCLC/间皮瘤)如何通过治疗和进化:理想的聚焦于肿瘤材料,在这些材料中,原发和配对的转移性活组织检查和生殖系DNA可以得到深入的临床注释。
确定致死性亚克隆的起源以及治疗如何影响复发肿瘤的亚克隆组成
c.确定癌症进展、多样化和适应/耐药的驱动因素;识别通过不同的组织轨迹引导肿瘤的组合驱动事件。
罕见肺癌队列亚域 霍尔斯顿,斯旺顿,坎贝尔,芬内尔 a.解决不同的肺癌分子队列在单个患者群体中的优势,例如,为什么女性非吸烟者特别容易获得EGFR激活突变或ALK重排?
b.解决特定非小细胞肺癌实体(如NSCLC向小细胞转化)的转化以及腺鳞癌的基因组驱动因素
c.破译恶性间皮瘤中可治疗的事件
免疫生物学子域名 克萨达,佩格斯,斯旺顿,米德尔顿 a.免疫微环境是如何编辑和约束肿瘤进化的?
b.识别和验证新的预测免疫治疗获益的基因组标记
放射肿瘤学子域名 副检察官芬恩,希利 a.说明放射治疗对紧急耐药疾病基因组景观的影响
b.识别与根治性辐射后疾病复发相关的体细胞和结构变异,这些变异可作为剂量增加的潜在生物标志物。
c.识别与DNA损伤修复途径缺陷相关的基因组特征,以及与临床结果的相关性(如HR和NHEJ)。
循环生物标志物子域名 迪弗,肖,斯旺顿,库克森,莫法特 a.通过热尸检程序,GeCIP将处理循环游离肿瘤DNA和CTC分数如何很好地反映原发和转移性肿瘤的肿瘤多样性。
b.产生单细胞基因组学和早期诊断的新方法
生殖系子域名 Houlston Bowcock,特恩布尔 a.发现具有肺癌风险的新基因组变异(对剩余100KGP队列进行病例对照分析),识别易导致肺癌和慢性肺病风险的新种系变异
通过生殖系发现和与生殖系突变状态相关的体细胞突变谱分析肺癌队列的特征
c.分析次要发现基因列表(MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM, APC, MutYH, BRCA1和BRCA2, VHL, MEN1, RET, RB1)中基因突变的种系数据
d.利用种系发现建立肺癌风险预测模型。选择高危个体进行肺癌CT筛查。
国民健康保险制度基础设施子域名 医学/临床肿瘤学医师/呼吸内科医师/病理学家及健康信息学和生物信息学 a.使GMC研究和临床基础188金宝慱应用程序设施适应100K基因组计划带来的研究性质的变化。在生物银行程序内整合项目,为所有新的癌症患者在NHS内治疗。
b.使临床电子病历与基因组学医学整合(FARR研究所)。
c.标准化收集采用标准护理和临床试验队列治疗的患者的临床数据,以便整合到肺GECIP中
临床,信息学和研究训练子领域188金宝慱应用程序 Jamal-Hanjani Mulatero,希利。
功能基因组学子域名 向下,Sahai Svejstrup a.解读肺癌生物学中新的基因组驱动因子的作用及其所通过的信号转导途径
b.了解肿瘤微环境在抑制肺癌进化中的作用
利用肺癌基因组数据集来理解肺癌基因组不稳定性是如何产生的

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